民航處新總部大樓座落於大嶼山赤臘角，鄰近香港國際機場。新總部將集合現時的航空交通管制中心及分散在不同地點的分部辦事處於同一大樓內，優化部門內部管理及運作效率。新總部大樓設計包括三個主要大樓，A 區設有一個全新而獨立的能源中心，B 區包括航空交通管制中心，辦公室丶訓練中心丶會議設施及禮堂，而 C 區則用作安放航空天線設施。

新總部大樓於設計及用料上都表現出現代化及明快的形象，並為職員提供安全舒適的工作環境。新總部以玻璃幕牆和鋁質骨架作為外牆的主要用料；而地面層則使用石料，給人平和及自然的感覺。三座大樓以位於中央的玻璃大堂及綠化前院入口處為中心，同時亦將室內透明度提到最高，飽覽大嶼山之開揚景觀及海景。

呂元祥建築師事務所與建築署丶民航處及承建商緊密溝通及合作，展開快捷的施工方案，確保按期完工。新總部大樓設計上還加入了多項環保建築理念，包括太陽追蹤裝置及光纖燈光系統，將自然光帶到室內走廊，更少不了綠化天臺花園，為員工提供憩息的地方及綠化的工作環境。除此之外，三層組合的低輻射玻璃幕牆亦能提高隔熱效能，將大樓與戶外高溫及噪音隔離，為離赤臘角香港國際機場僅數分鐘的民航處新總部大樓提供一片既寧靜又高端的環境。